Gli indirizzi scientifici del Liceo “Cecioni” sono caratterizzati dall'adozione, in tutte le discipline, di un metodo sperimentale che si fonda su un procedimento di tipo progettuale: dall'analisi dei problemi, prendendo lo spunto dalla realtà oggettiva, si procede alla progressiva individuazione dei contenuti e degli strumenti idonei alla loro soluzione. Questa metodologia, maturata nel corso dell'ormai lunga esperienza sperimentale, consente allo studente di orientarsi e di gestire in modo consapevole il proprio percorso di studi acquisendo la capacità di prospettare soluzioni personali di fronte alle problematiche che si presentano.

Nella pratica didattica delle materie scientifiche trova ampio spazio l'uso dei laboratori e dei mezzi informatici. Il computer viene utilizzato, oltre che nella specifica materia di Informatica, anche in altre discipline quali Disegno e Tecnologia e Matematica, in cui si ricorre a software specifici per il disegno tecnico, lo sviluppo della geometria, l'elaborazione statistica dei dati o il calcolo simbolico. Gli studenti, nell'ambito delle materie scientifiche, grazie all’attività di laboratorio, possono sperimentare direttamente, imparando ad agire in modo coerente, logico e consapevole, nel rispetto delle norme di sicurezza. Questo avvia ad un'educazione scientifica che parte dall'imparare ad osservare per arrivare a saper progettare.
Negli indirizzi scientifici è previsto in orario curricolare lo studio di alcuni moduli ECDL che consente di sostenere, in sede e a costi ridotti, gli esami per il conseguimento della Patente Europea di Informatica, riconosciuta sia in ambito lavorativo sia come Credito Formativo Universitario.
La dimensione sperimentale degli indirizzi di questa area, oltre a preparare adeguatamente a tutte le facoltà di impianto scientifico, apre anche concrete possibilità di formazione professionale soprattutto nell’ambito dell’informatica e della grafica.